До нынешних дней ученые не понимали, какие имеются отличия между свиным гриппом и обычным, и по какой причине эпидемии гриппа распространялись по всему миру между 1918-х и 2009-х годах. Но биологу Ниру Бен-Таль, аспиранту Дафна Meроз в сотрудничестве с доктором Томером Герцом удалось разработать единственный в мире вычислительный метод, который помогает прогнозировать грядущую эпидемию гриппа.
Ученные решили опубликовать их исследование, поскольку оно является весьма ценным инструментом, который помогает вычислить вирусную стратегию мутации, так же отслеживаются разные штаммы вируса и разрабатываются нужные защитные антивирусные препараты и вакцины. Ученые предполагают, что дальнейшая работа поможет им разработать более точную вакцину, которая сможет бороться с этими вирусными мутациями.
Благодаря такому методу стало ясно, что мутации в аминокислотном вирусе в конкретной позиции поможет объяснить ученым, каким образом новый штамм вируса гриппа с успехом в 2009 году сумел распространиться по всему миру. Данные мутации дали возможность вирусу отклониться от защиты иммунной системы и двух вакцин, которые на тот момент были.
Бен-Таль пояснил, что наша иммунная система постоянно борется с вирусами. А вирусы склоны к постоянной мутации, для того чтобы не был замечен, и тогда получается, что иммунная система играет с ним в «догонялки», точнее сказать она пытается найти вирус, затем мобилизовать его с помощью иммунной системы нашего организма.
Для того чтобы определить, как в 2009 году распространился этот вирус, биолог Бен-Таль вместе со своими коллегами решили проанализировать белок гемагглютинин. Поскольку именно он контролирует способность вируса и затем в организме соединяется с клеткой-хозяином и передает генам, который содержит необходимую информацию, из-за которой начинает размножаться вирус.
Ученные использовали статистические алгоритмы и решили сделать сравнение между штаммом H1N1 гриппа, который был в 2009 году и штаммом H1N1 свиного гриппа. И тогда они выяснили, что произошли серьезные перемены в последовательности аминокислот, которые поставили под угрозу иммунную систему, которая не могла узнать и среагировать на вирус.
Из-за того, что мутация вируса происходила на огромной скорости, вирусам удалось широко и быстро распространиться, и по этой причине вакцины были неэффективны. Теперь в будущем ученные смогут улучшить их метод расчета, который будет использован, для того чтобы сравнивать разные штаммы вирусов.